İkinciafşar köyümüz Bolu iline 64 km, Ankara iline 130 km, İstanbul iline 315 km, Zonguldak iline 153 km, Karabük iline 103 km, Gerede ilçesine 13 km uzaklıktadır. Köyün kapladığı alan yaklaşık olarak 78000 dönümdür,kurulduğu alan 3500 dönümdür.Köyümüz doğusunda Zeyneller köyü ve bu köye bağlı Kurtlar mahallesine 3 km, kuzeydoğusunda Akbaş köyüne 4 km, Yaman (ÇALAMAN Köyünün) mahallesine 3 km, kuzeyinde Burgucu (Eymür Köyünün) mahallesine 2 km, batısında Ümit Köyüne 2 km, güneyinde 1.AFŞAR Köyüne 1 km, güneydoğusunda Ağızören Güney Köy-İnköy ve Danişmentler köylerine ise 5 km uzaklıktadır.
Batı Karadeniz bölgesinde yer alan köyümüz Gerede'nin güney doğusunda, Ankara-İstanbul E-5 karayoluna 4 km uzaklıktadır.Jeomorfolojik yapısı 3. jeolojik devir arazisi üzerinde yer alır. 3.jeolojik devirde meydana gelen Köroğlu Dağları ile Gerede'nin kuzeyinde uzanan Kuzey Anadolu Genç Kıvrımları içinde yer alan ARGUT dağlarının arasındaki Dörtdivan Graben (Çöküntü) ovasının doğusunda yer alır. Köyümüzün arazisi kıraç olup doğuya gidildikçe yükselen dağlık alan oluşturur.

Köyümüz, Ulusu vadisinde kurulmuş olup çevresindeki köylere göre daha düz bir yapısı vardır. Çevre köylerden daha verimli bir alan üzerindedir. Çalaman deresinden ve İnceöz deresinden sulama imkanı olduğundan bahçe işlerinde daha ileri seviyede görülmektedir. 1970'li yıllarda Çalaman Deresine sulama kanalı yapılarak köyün batısındaki arpalıkların sulanması yoluna gidilmiştir.